Este museo presenta las diferentes culturas pre-incaicas con exposiciones de cerámica, textiles, utensilios, joyas, etc. Lo más destacado de la muestra son las momias, una de las cuales es aterradora, con una mano brillante con largos clavos clavados delante de su cara. Algunas altas esculturas de piedra también son muy impresionantes. Al final de la visita, se presenta el Museo Nacional de Historia en un patio florido, donde vivieron los héroes de la independencia San Martín y Bolívar.